تحقیق کاربردمتاژنومیکس در تنوع بخشی و کشف محصولات جدید زیست فناوری

فهرست
چکیده:
مقدمه
متاآمیکس
متاژنومیکس
توالی یابی
خوانش ها
کانتیگ ها
توالی یابی نسل های جدید NGS
راهبردهای شناسایی میکروب ها به وسیله متاژنومیکس
متاترانسکریپتومیکس
کاربردمتاژنومیکس کشف محصولات جدید زیست فناوری
نتیجه گیری:
منابع

چکیده:
باکتری ها از جمله اولین ترین و متنوع ترین جانداران پدیده آمده بر روی کره زمین هستند و بدون عملکرد آن¬ها حیات بر روی زمین ممکن نمی باشد. به همین دلیل شناخت ژنهای جدید، ساخت آنتی بیوتیک های جدید و ترکیبات ضد سرطان و نظایر آن ها شود و در حوزه علوم زیستی از اهمیت بالایی برخوردار است. مسئله شناسایی ژنوم باکتری¬ها از روی توالی¬های دی ان ای بدست آمده به صورت مستقیم از نمونه های محیطی به نام متاژنومیکس شناخته می شود. متاژنومیکس تجزیه و تحلیل ژنومی میکروارگانیسم ها از طریق استخراج مستقیم و کلون کردن DNAاز محیط های طبیعی آنهاست. روش های غربالگری به منظور انتخاب ژنهای خاص از درون کتابخانه های متاژنومی برای تعیین کاتالیزورهای زیستی و همچنین مولکول های فعال زیستی جدید طراحی شدند. حامل ها یا کروموزم های مصنوعی باکتریایی مختلف و ابزارهای داده¬پردازی زیستی و پایگاه های اطلاعاتی به منظور مطالعه کامل تنوع زیستی و ژن ها توسعه یافتند.
در متاژنومیکس توالی¬یابی مستقیم، شناسایی ژنها و ژنوم های موجود در زیست بوم های پیچیده میکروبی انجام می شـود. ویـرومیکس پـژوهش بـر متـاژنوم هـای ویروسی است. در متاترانسکریپتومیکس mRNAآنالیز می¬شود که به دلیـل ناپایـداربـودن آن در نمونـه هـای زیست محیطی، گردآوری و رمزگشایی از آن چـالش اصـلی ایـن آمـیکس اسـت. شناسـایی و انـدازه گیـری پروتئینهای گوناگون که میتواند به طور مستقیم فعالیت میکروبـی را انـدازه گیـری کنـد، در متـاپروتئومیکس انجام می شود. هم-اکنون، روشهای متاآمیکس به سرعت در حال توسعه و تکامـل فناوریهایی هستند که دستیابی ما را هم به گوناگونی زیستی و هم به بیان ژن در تمامی محـیط زیسـت هـا ازبدن انسان تا خاک و اقیانوس، شدنی می¬کنند. به این ترتیب قوانینی را که میلیونها سال اسـت حـاکم هسـتند، درک کرده و از رازهای پنهان آنها رمز خواهیم گشود. متاژنومیکس باعث می¬شود تا پاسخ کلیدی پرسشهای زیست محیطی پیدا شود، همچنین دانشمندان را قادر می¬سازد تا پتانسیل ارتباط توابع میکروارگانیسمهای مشخص در جوامع چند گونه ای مانند خاک را پیدا کند.
واژه¬هـای کلیـدی: متـاآمیکس، متـاژنومیکس، متاترانسـکریپتومیکس، زیست فناوری